GALEAS™ Tumor – 基於NGS的癌症全方位基因組檢測

GALEAS™ Tumor
精準癌症基因組檢測解決方案 (NGS)


GALEAS™ Tumor 是一款先進的 NGS 檢測方案,提供全面的癌症基因組分析,涵蓋 SNV、CNV、INDEL、TMB、MSI 及關鍵免疫腫瘤學生物標誌物

先進的次世代定序腫瘤突變檢測方案

GALEAS™ Tumor 是一項領先業界的次世代定序(NGS)解決方案,專為癌症基因體分析而設計,能深入剖析腫瘤基因變異,協助偵測具臨床意義的生物標記,提供腫瘤突變負荷(TMB)、微衛星不穩定性(MSI)與結構變異等關鍵資訊。

The table of contents

GALEAS™ Tumor 特色亮點

臨床相關、內容即時更新

  • 依循英國國民健康署(UK NHS)National Genomic Test Directory、NCCN、FDA 與 ESMO 最新臨床指引
  • 涵蓋 519 個基因,包括 SNV、INDEL、CNV 及融合基因等
  • 提供 TMB 與 MSI 評分,協助免疫療法預測
  • 涵括 64 個藥物基因體 SNPs, 遺傳性與小兒腫瘤相關資訊,並支援實體腫瘤的 HLA 分型

高階免疫腫瘤學標記檢測能力

  • 整合 TMB 與 MSI 分析,全面評估腫瘤基因體不穩定性
  • 支援精準醫療策略,提升免疫治療預測準確性

強大易用的 GALEAS™ 分析軟體

  • 雲端平台,快速且準確進行變異分析(涵蓋 SNV、INDEL、SV、CNV、TMB、MSI)
  • 高解析度 CNV 偵測(>1Mb),提升結構變異辨識能力
  • 友善操作介面,搭配面板共同開發的生物資訊解決方案

GALEAS™ Tumor 定序面板設計

此次世代定序(NGS)方案涵蓋關鍵驅動突變與免疫腫瘤學核心生物標記,具備以下特點:

  • 身分識別追蹤用 SNPs
  • 涵蓋 519 個基因 的 SNV、CNV、INDEL 分析
  • 強化 CNV 背景設計,提升複製數變異(Copy Number Variation)偵測準確性
  • 全面涵蓋與膠質瘤相關的 1p/9q 共缺失區域
  • 可偵測結構變異,包括:ALK、BRAF、EGFR、FGFR2、FGFR3、NTRK1、NTRK2、RET、ROS1、TMPRSS2
  • 收錄 64 個與腫瘤學相關的藥物基因體 SNPs
  • 提供實體腫瘤特性分析所需的 HLA 基因分型資料

高精度變異檢測能力

SNV 與 INDEL 準確度

  • 透過 FFPE 參考樣本進行驗證,在 500x 深度下達成 R² 相關係數 0.99(圖1)
圖1 FFPE 參考樣本中 SNV 與 INDEL 變異回溯率圖示
  • 在 50 個大腸直腸癌(CRC)樣本中達成 100% 體細胞突變檢出準確率(圖2)
圖2 50 例 CRC FFPE 樣本的 Oncoplot,顯示在已知癌症熱點基因中的體細胞突變檢出結果

複製數變異(CNV)檢測

  • 提供解析度高於 1Mb 的 CNV 偵測能力
  • GALEAS™ Tumor CNV 數據與淺層全基因體定序(sWGS)結果呈現高度相關性(圖3)
圖3 CRC 樣本中 GALEAS™ Tumor SNP 背景資料與 sWGS 比較結果
  • 成功驗證 EGFR 與 MET 基因的 CNV 變異偵測能力(分別測試 3、6、12 拷貝數)
圖5 使用 CNV 肺部與腦部混合參考標準進行基因層級 CNV 驗證,包含 (A) 12 拷貝、(B) 6 拷貝、(C) 3 拷貝。重點基因:EGFR 與 MET

微衛星不穩定性(MSI)評分

  • 在 24 個 CRC FFPE 樣本中成功檢出 23 個 MSI-High 狀態
  • 可精準區分正常樣本、微衛星穩定(MSS)及高度不穩定(MSI-H)樣本
圖4 GALEAS™ Tumor MSI 分數與既知 MSI 狀態比較,包括 CRC 原發腫瘤(MSI-H)、健康樣本(MSS)與參考標準樣本

腫瘤突變負荷(TMB)分析

  • 在 CRC 樣本中 TMB 分數與 MSI 狀態呈現高度相關性
  • 即使在低突變量的小型定序面板中,亦能提供穩定可靠的 TMB 評分
Figure 6 GALEAS™ Tumor 在 50 個 CRC 樣本中的 TMB 分數與 MSI 狀態比較結果

高效率定序與卓越覆蓋表現

  • 高目標區域擷取率,大幅提升定序效率
  • 在臨床關鍵基因上實現均一覆蓋,確保數據一致性
  • 支援精準且具重現性的變異檢出,提升臨床應用可靠性

GALEAS™ 分析軟體

  • 專為提升 GALEAS™ Tumor 面板效能 而設計
  • 支援 準確的 TMB/MSI 分析,並結合精簡高效的生物資訊分析流程

GALEAS™ Tumor 是一套經臨床驗證的全方位次世代定序(NGS)解決方案,可在單一工作流程中完成 519 個基因的 SNV、CNV、INDEL 及 TMB/MSI 分析。

藉由強化的探針設計、全面的基因覆蓋範圍與高度一致的覆蓋深度,GALEAS™ Tumor 可精準且靈敏地檢出 SNV、INDEL、SV 及 CNV。當搭配 GALEAS™ Analysis Software 使用時,從樣本準備到分析,皆能提供直覺化且友善的使用流程。

References

  1. Ciriello G, Miller ML, Aksoy BA, Senbabaoglu Y, Schultz N, Sander C. Emerging landscape of oncogenic signatures across human cancers. Nature genetics. 2013;10):1127-33.
  2. The ICGC/TCGA PanCancer Analysis of Whole Genomes Consortium. Pan-cancer analysis of whole genomes. Na- ture. 2020: 82-93.
  3. Endris V, Buchhalter I, Allgäuer M, Rempel E, Lier A, Vol- ckmar AL, et al. Measurement of tumor mutational bur- den (TMB) in routine molecular diagnostics: in silico and real-life analysis of three larger gene panels. International journal of cancer. 2019;144(9):2303-12.
  4. Schrock AB, Ouyang C, Sandhu J, Sokol E, Jin D, Ross JS, et al. Tumor mutational burden is predictive of response to immune checkpoint inhibitors in MSI-high metastatic colorectal cancer. Annals of Oncology. 2019;30(7):1096-103.
產品資訊
ParametersSpecification
Enrichment methodHybridization and capture
Number of genes519
Capture Panel Size3.74Mb
Sequencing platformIllumina
TargetsGenes associated with common cancers
Variant typesSNVs, CNVs and indels
Input DNA requirements10ng-200ng
Sample typegDNA from FFPE, frozen tissue or blood
Multiplexing guidance for sequencing25M reads per sample required to achieve 500x. This equates to 5Gb per sample
訂購資訊
Product NameCatalogue No.
GALEAS Tumor Kit Frag A
(96 samples)
NGS_GAL_TCP_FR_96_A
GALEAS Tumor Kit Frag B
(96 samples)
NGS_GAL_TCP_FR_96_B
GALEAS Tumor Kit Frag C
(96 samples)
NGS_GAL_TCP_FR_96_C
GALEAS Tumor Kit Frag D
(96 samples)
NGS_GAL_TCP_FR_96_D
GALEAS Tumor Kit Frag
(16 samples)
NGS_GAL_TCP_FR_16
  • A: Adapter標號 1~96
  • B: Adapter標號 97~192
  • C: Adapter標號 193~288
  • D: Adapter標號 289~384
技術文件
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