Cell3™ Target:Custom – cfDNA解析向けカスタムNGSパネル

Cell3™ Target: Custom
高感度cfDNA解析のためのカスタムNGSパネル


Cell3™ Target: Custom は、cfDNA解析に最適化された高感度で高精度なカスタムNGSパネルを提供します。がん診断、NIPT、リキッドバイオプシー研究に最適です。

高感度かつ高精度 ― cfDNA解析に特化したカスタムNGSパネル

Cell3™ Target: Custom は、セルフリーDNA(cfDNA)解析に最適化された、柔軟なカスタマイズが可能な次世代シーケンシング(NGS)パネルです。ハイブリダイゼーションキャプチャ法とIlluminaテクノロジーを活用し、極めて低頻度の変異も高精度で検出可能。がん診断、リキッドバイオプシー、非侵襲的出生前検査(NIPT)など、さまざまな用途に最適です。

  • 最短2時間以内で完結する効率的なワークフローにより、迅速かつ信頼性の高い解析結果を提供します。

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なぜcfDNA解析にCell3™ Target: Customを選ぶべきか?

多様な遺伝子変異を正確に検出

Cell3™ Target: Customは、以下のような遺伝子異常を網羅的かつ精密に同定します:

  • SNVs(単一塩基変異)
  • InDels(挿入および欠失変異)
  • CNVs(コピー数変異)
  • SVs(構造変異)

この幅広いカバレッジは、研究用途にも臨床診断用途にも信頼性の高いゲノムプロファイリングを可能にします。

超高感度な変異検出性能

Cell3™ Target: Custom以下の技術により、極めて低頻度な変異の検出を実現しています:

  • デュアルインデックスおよび一意な分子識別子(UMI)を用いてエラーを低減
  • 0.1% の変異アレル頻度(VAF)まで検出可能

がんの早期発見や治療モニタリングといった高感度が求められる分野での活用に最適

幅広い検体への対応実績

Cell3™ Target: Customは、以下の多様なサンプルタイプからのcfDNA解析において、優れた実績があります:

  • 血液
  • 尿
  • 唾液
  • 直腸粘膜

この柔軟性により、臨床現場や研究環境での非侵襲的なゲノム解析を実現します。

多岐にわたるアプリケーション

Cell3™ Target: Customは、以下のような幅広い分野で活用されています:

  • がん診断
  • 微小残存病変(MRD)の検出
  • 非侵襲的出生前診断(NIPT)
  • リキッドバイオプシー研究

その汎用性により、診断精度の向上と患者管理の最適化が可能となります。

ユーザーストーリー:唾液由来cfDNAを用いたOSCCの早期検出

ロンドン大学キングス・カレッジのDr. Ahmedは、口腔扁平上皮がん(OSCC)の再発を早期に発見することの難しさに直面していました。従来の画像診断では、治療可能な段階での再発検出が困難だったため、同氏の研究チームはNonacus社のカスタムパネルを用いて、OSCC患者の唾液由来cfDNAの解析に取り組みました。

OSCC向けに設計された専用パネルを使用することで、唾液サンプルから体細胞変異の同定に成功。12遺伝子からなるパネルを20,000倍のカバレッジで解析することで、高い感度と特異性を両立させました。唾液中で検出された変異のアレル頻度は0.004〜0.061%と非常に低いレベルに及びました。

この手法により、OSCCの再発を従来よりも早期に発見できるようになり、唾液cfDNAが信頼性の高い非侵襲的な腫瘍マーカーであることが証明されました。検出率は82%と高く、今後のがん診断における重要なツールとして期待されています。

Ahmed, Ahmed A., et al. “Mutation detection in saliva from oral cancer patients.”
Oral Oncology 151 (2024).

あなた専用のNGSカスタムパネルを設計しましょう

  • 完全カスタマイズ対応
    臨床・研究ニーズに合わせて、柔軟にパネル内容を調整可能です
  • 多様な入力形式に対応
    以下の形式で簡単にアップロードが可能です:BEDファイル,遺伝子リスト,ゲノム座標
  • 高度なアルゴリズムで設計を最適化
    小規模パネルでも、均一なターゲットカバレッジと高効率を実現
  • リアルタイムでのフィードバック
    設計中に以下の情報を即時確認:ターゲットカバレッジの予測,プローブ詳細の分析,最適化に向けたアドバイス

新しいパネルの作成でも、既存パネルのカスタマイズでも、当社のパネル設計ツールを使えば、NGSパネルの設計がスムーズかつ簡単に行えます。

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最適なシーケンス性能とコスト効率

Cell3™ Target: Custom は、優れた感度を維持しながら効率性を最大化するよう設計されています:

  • 小規模パネルでも均一なカバレッジ
  • cfDNA 25ng から 0.1% の VAF までの低頻度変異を検出
  • 高精度を保ちながら、シーケンスコストを削減

高いオンターゲット効率と信頼性の高い検出精度

従来のキャプチャ手法と比較して、Cell3™ Target: Custom は以下の優位性を示します:

  • 高いオンターゲット率
  • オフターゲットノイズの軽減
  • 単一遺伝子から1,000遺伝子規模まで、すべてのパネルで安定した性能を実現

SeraCare標準参照サンプルを用いた検証

  • Cell3™ Target: Custom は、VAF 0.6% という非常に低い頻度でも、変異を正確に検出することが確認されました。これは高い感度と信頼性を裏付けています。
図1: カバレッジの均一性およびオンターゲットキャプチャの比較結果。Nonacusは競合A社よりも優れた性能を示しました。
図2: HBB遺伝子キャプチャパネルを用いて、0.0%、1.0%、2.5%の既知のVAFを持つ人工gDNAで測定。観測値は予測値と高い一致を示しました。
注文情報

Cell3™ Targetパネルは、2種類のライブラリ調製キットをご用意しています。

  • フラグメンテーション対応キット:DNA(Genomic、FF、FFPE)サンプルに使用します。
  • ノンフラグメンテーション対応キット:cfDNAに使用します。
Panel SizePanel Size from XS(50 probe)-XXL(25000 probe)
Panel size based on probe numberFragNon-Frag
48 SampleNGS_C3C_(size)_FR_48NGS_C3C_(size)_NF_48
96 SampleNGS_C3C_(size)_FR_96_A/B/C/DNGS_C3C_(size)_NF_96_A/B/C/D
  • A:インデックス番号 1~96
  • B:インデックス番号 97~192
  • C:インデックス番号 193~288
  • D: インデックス番号 289~384

* サンプルのマルチプレックス化に柔軟性を持たせるため、96検体用キットにはアダプタープレートを提供しています。

製品リソース
My Nonacus用マニュアル
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